对于发生在外阴、肛周典型的疣状或菜花状肿物，尖锐湿疣诊断是很简单的，临床经验丰富的皮肤科医生一看便可确诊。对早期及亚临床感染的损害，可在醋白试验的基础上，作阴道镜(女性)或尿道镜(男性)等检查，并进一步取病变组织作组织病理学检查以确诊。确诊仍有困难的情况可以病理组织活检确诊。
1、有直接性接触史、配偶感染史或间接接触史。
（注：大部分发病原因是直接性接触式。）
2、临床表现：外生殖器、会阴或肛门周围多个粉红色、灰白色或灰褐色赘生物，可呈扁平、乳头状、鸡冠状或菜花状;大多无自觉症状，部分患者有痒感、异物感、压迫感或疼痛。
（注：典型临床特征是菜花状疣体，弥漫性发展，无明显瘙痒、疼痛。）
3、实验室指标：皮损活检有HPV感染的特征性凹空细胞，醋酸白试验阳性
（注：醋白试验并不是一个特异性的试验，对有些慢性炎症、非特异性炎症或外伤后初愈的上皮可出现假阳性的结果。组织病理是确诊的重要依据。）
易误诊疾病鉴别：1、假性湿疣：假性湿疣多发生在女性小阴唇的内侧面，为多数淡红色丘疹，均匀分布，为鱼籽状。组织病理学检查无挖空细胞，临床一般无需治疗。
2、阴茎珍珠样丘疹：发生在龟头后冠状沟处，为皮色或淡红色针帽大柔软的小丘疹，表面光滑。沿冠状沟排列成一行或二行。系正常所见，无需治疗。醋白试验阴性，如不能确诊可定期随访，阴茎珍珠样丘疹的形态不会发生变化，不会增大。在不少男性的包皮系带两则，可见一、二个如针帽大的白色丘疹，稍隆起皮面，表面光滑，这也是正常所见，无需治疗。。
3、阴茎系带旁腺丘疹、丘疹性纤维瘤：阴茎系带旁对称的数个小丘疹，表面光滑，形如鱼卵，丘疹基底较宽，无明显自觉症状。
4、皮脂腺异位症：龟头、包皮内或小阴唇等部位可见针尖、粟粒大小，孤立而稍隆起、成群或成片的*白色或淡*色丘疹，排列均匀、错落有致，无红肿、瘙痒、疼痛。
根治疗法推荐：传统的药物、激光、手术、电灼等对患者创伤大，治疗过程痛苦，而且最重要的是会复发，一切都是徒劳，目前，中医治疗尖锐湿疣最为有效的是南京优嘉病*疣医学研究所通过合理的中医药组方“内服+外用”结合治疗。
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