1、典型的尖锐湿疣一般不需作实验室检查即可作出诊断。
2、当患者症状不典型，部位不典型，特别是妇女，其阴道口可有类似于尖锐湿疣的假性湿疣，需作实验室检查以明确诊断。常用的实验室检查有如下的方法：
①细胞学检查：取阴道、子宫颈等部位的湿疣组织作成涂片，作帕氏染色。在涂片中可以见到两种细胞，一种细胞的核周围有晕环，它占据了细胞浆的大部分，而将细胞浆压缩到边缘呈浓缩状，此种细胞称为空泡化细胞，它来源于浅层的鳞状上皮细胞；另一种细胞称为角化不良细胞，可单个或成堆分布，胞浆呈橙红色至淡*色，核小而致密。在尖锐湿疣病的的涂片中这两种细胞常可混合存在。
②组织病理变化：主要为角化不全，棘层高度肥厚，乳头瘤样增生。粒层和棘层上部细胞有明显的空泡形成，一般临床称“挖空细胞”或“凹空细胞”。棘细胞基底细胞有相当数量之核分裂，颇似癌变，但并非癌变，细胞排裂规则，且增生上皮和真皮之间境界清楚。
③组织化学检查：取少量病损组织制成涂片，用特异性抗人类乳头瘤病*的抗体作染色。如果病损中有病*抗原，则抗原抗体结合，在用过氧化物酶抗过氧化物酶（PAP）方法中，核可被染成红色。此法特异性强且较迅速，对诊断有帮助。
尖锐湿疣是性病中比较容易诊断的一种，外观比较典型的尖锐湿疣，通常医生只凭肉眼观察即可判断，绝大多数都不会诊断错误；不典型尖锐湿疣的诊断需要实验室检查。而众多检查方法中，以病理活检最为准确，是诊断尖锐湿疣的金标准。
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